「Cell Research」北大湯富酬團隊:一種長讀單細胞ATAC測序方法,同步檢測染色質可及性和遺傳變異
目前,對單個細胞內開放染色質區域進行檢測的一種成熟方法是:透過下一代測序(NGS)平臺,使用測序技術對轉座酶可及性染色質(transposase-accessible chromatin)進行單細胞測定(即scATAC-seq)
2023-01-08seqscNanoATAC測序scATAC染色質
中國科技網:我科學家揭示肺動脈高壓發病新機制
【來源:陝西省科學技術廳_媒體聚焦】2022年11月3日《中國科技網》記者2日從西安交通大學獲悉,該校第一附屬醫院袁祖貽教授團隊發現了輔啟用子MED1與轉錄因子KLF4協同作用,透過調節染色質重塑和增強子-啟動子的相互作用而調控內皮細胞功能
Nature:科學家開發活細胞轉錄組測序技術,首次實現了活細胞全基因表達的連續觀測
8月17日,中國科學院深圳先進技術研究院合成生物學研究所研究員陳萬澤以共同第一作者身份在國際頂級期刊Nature上發表長文,介紹了研究團隊在國際首創的活細胞轉錄組測序技術(Live-seq),該技術首次讓單細胞進行轉錄測序後,依然能保持細胞
華中農大李林課題組開發廉價高效的tsCUT&Tag用於體內植物轉錄因子結合位點的快速鑑定
由於很難從植物不同組織中獲得高質量的原生質體並實現高效率轉化,為了推斷不同組織和發育階段轉錄因子的動態調節網路,該研究利用tsCUT&Tag和ATAC-seq資料結合機器學習的方法來預測不同組織中的TFBS
Nature:陳萬澤等開發活細胞轉錄組測序技術
這項研究開發了活細胞轉錄組測序技術(Live-seq),首次實現了讓單細胞進行轉錄組測序後依然能夠保持細胞存活
北大尹玉新團隊發現單鏈DNA結合蛋白RPA1的全新生理功能
為了深入研究 RPA1 在脂肪肝發生發展中的作用,研究團隊新構建了肝臟組織特異性Rpa1(Liver-Rpa1-KO)敲除的小鼠模型,發現 Liver-Rpa1-KO 小鼠在四週年齡患脂肪肝並逐漸進展為肝癌,在56週年齡的時候66
鴻星爾克,豪擲900萬,殺入單細胞測序領域
本輪融資將用於加速公司多款單細胞測序技術平臺(Paired-seq,Digital-seq,和Well-paired-seq)的深度研發與商業化推廣落地,並透過在腫瘤、優生優育、以及生物製藥領域的合作,持續挖掘基於單細胞技術的精準醫療應用潛
這種新方法篩查宮頸癌,更快更準,還能避免不必要陰道鏡檢查
為此,法國Pasteur研究所病原體探索實驗室的研究團隊開發了一種新型的體外分子診斷程式——HPV RNA-Seq,用於檢測高危HPV感染,以及識別宮頸高級別鱗狀上皮內病變(HSIL)患者
乾貨|三點帶你快速瞭解TCP協議的可靠性,乾貨滿滿
接收方在收到報文後也會計算 checksum:①如果計算結果符合期望值,說明資料包沒有受到干擾/損壞②如果不符合期望,一般會直接丟棄該資料包2. tcp協議為報文加上了序號,解決了亂序和冗餘TCP 的報文結構上維護著一個 seq (Sequ
神經細胞如何進行DNA損傷修復過程
2021年3月25日,美國國立衛生院癌症研究中心 (NIH/NCI)André Nussenzweig課題組,國家神經疾病與中風研究所 (NIH/NINDS)Michael Ward課題組和英國薩塞克斯大學Keith W. Caldecot
研究開發單細胞測序分析TEs表達的工具包
相對scRNA-seq研究轉錄組而言,單細胞ATAC-seq(scATAC-seq)等單細胞基因組技術研究的物件是染色質,染色質開放性與表觀遺傳修飾情況在很大程度上決定了基因表達丰度,以scATAC-seq為代表的單細胞基因組學技術的開發,
科學家首次解析腫瘤染色體外DNA的環狀結構與功能
研究團隊使用染色質構象捕獲及測序技術,PLAC-seq(或者叫Hi-ChIP,一種資訊簡併的Hi-C技術)和4C-seq,以及CTCF與SMC3的ChIP-seq,證實了ecDNA染色質也能形成三維結構,並且存在拓撲相關結構域
生物資訊就該這麼學(3):聽說你不想學習測序原理?
為什麼要做單細胞測序10X genomics單細胞測序,是這兩年以來在生物科研領域最火的一個技術之一
Linux 2021 最新檔案系統層中的size_t-to-int 漏洞
2/ 建立一個執行緒,它 vmalloc() 訪問一個小的 eBPF 程式(透過BPF_PROG_LOAD),然後我們阻止這個執行緒(透過 userfaultfd 或 FUSE),在核心進行 JIT 編譯之前,eBPF 程式已經透過核心 e