LTR和轉錄因子調節熱應激下毛竹的PHRE1和PHRE2活性
2022-02-21由 瑞源酵母功能基因組學 發表于 林業
毛竹是熱性的嗎吃會上火嗎
LTR 逆轉錄轉座子在植物生長、基因組進化和環境應激反應中發揮重要作用,
但它們對熱應激的調節反應仍不清楚。
我們研究了毛竹的兩個
LTR逆轉錄轉座子PHRE1和PHRE2響應熱應激的活性。
近
日,浙江農林大學周明兵研究團隊在
BMC Plant Biology上發表題為“Long terminal repeats (LTR) and transcription factors regulate PHRE1 and PHRE2 activity in Moso bamboo under heat stress“的學術論文,揭示了長末端重複序列(LTR)和轉錄因子調節熱應激下毛竹的PHRE1和PHRE2活性。
在
我們之前的研究中,我們報道了毛竹基因組中的兩個
LTR 逆轉錄轉座子PHRE1和PHRE2。值得注意的是,GUS在未轉化的對照植物中不存在轉基因表達。
這意味著
PHRE1和PHRE2都是活性元件並具有啟動子活性。
由於
PHRE 元素也參與熱應激反應, PHRE 元素和 TF 之間是否存在任何相互作用。有趣的是,在酵母誘餌-獵物試驗中,這些 TF 顯示出與 PHRE 元件相互作用的特定模式。發現 TCP20 (PH01001418G0330) 和 DOF2 (PH02Gene21543) 與酵母細胞中的PHRE1相互作用,酵母細胞能夠在含有 SD/-Ura/-Trp/X-Gal 的基本培養基上生長(圖
7A
)。它們似乎沒有與
PHRE2元素相互作用。而 GATA (PH02Gene06016) 是唯一被發現與PHRE2相互作用的TF,因為相應的酵母細胞可以在基本培養基上生長良好(圖
7
B)。攜帶陰性對照質粒(AD、BD、AD-TCP20/DOF2/GATA plus、BD、AD plus BD- PHRE1 / PHRE2)的酵母轉化體不能生長(圖
7
)。
這些結果證實了
TCP20 和 DOF2 與PHRE1以及 GATA 與PHRE2的選擇性相互作用,進一步為PHRE1和PHRE2啟用中5‘LTR的啟動子活性提供了證據。
圖7酵母單雜交試驗顯示TCP20、DOF2和GATA轉錄因子(TF)與PHRE1和PHRE2 LTR 的相互作用
結果表明
有或沒有
CaMV35s 啟動子的PHRE1和PHRE2的差異過表達在轉基因植物的熱脅迫下表現出增強的表達。轉錄活性研究表明在熱脅迫下毛竹野生型和擬南芥轉基因植物的轉座活性和複製數增加。轉基因植物中啟動子活性的比較表明5’LTR啟動子活性高於CaMV35s啟動子。此外,
酵母單雜交
(Y1H) 系統和植物生物分子熒光互補 (BiFC) 測定揭示了熱依賴性轉錄因子 (TF) 與 5‘LTR 序列的相互作用以及 TF 與pol和gag 的直接相互作用
。