一站式進化分析資料庫

我們在做多基因x分析的時候，有時候會做需要對多個基因進行序列匹配來檢視其序列之間的相似性，觀察不同基因之間的序列的進化關係。這一次我們就介紹一個一鍵構建進化樹同時可以繪製進化樹的網站：NGPhylogeny。fr，這個資料庫包括了現在主流的一些進化分析的軟體，過自己選擇使用哪個軟體來完成一鍵式的進化分析。

這個資料庫分成三個模式：

One Click

： 軟體和引數預設來進行進化分析。

Advanced

： 軟體預設，各個軟體的引數自己來選擇。

A la Carte

： 自定義軟體+自定義引數。

PART1

輸 入

我們使用

One Click

來進行演示。在這個一站式分析裡面我們只需要選擇自己想要分析的流程即可，不同的流程之間的區別只是在於

Tree Inference

使用的軟體不同而已。

我們需要做的就是上傳或者輸入fasta資料就行。輸入完fasta的序列之後 ，點選Submit即可。

PART2

輸 出

經過一段時間的分析後，我們可以得到各個軟體的分析結果。

對於每個軟體的分析結果，資料庫也是提供了資料下載和檢視的地方，例如對於整體單個氨基酸比對的結果。

另外，這個資料庫還提供了一個外部連結到

iTol

的網站，這個網站可以用來自定義進化樹。

透過這個網站。我們可以進一步的自定義自己的進化樹。來畫出更好看的進化樹結果。