最新研究發現光週期介導的染色質開放程度變化具有組織細胞特異性
2022-03-04由 BioArt植物 發表于 林業
擬南芥屬於維管植物嗎
Plant Cell | 劉良玉/路則府合作發現光週期介導的染色質開放程度變化具有組織細胞特異性
責編 | 王一
開花時間是植物從營養生長向生殖生長的重要轉變,它與植物的環境適應性和農作物產量密切相關。長期以來,科學家以擬南芥為模式植物,持續關注光週期
(指一天中白晝和黑夜的相對長度)
、赤黴素、春化、年齡等多條開花時間途徑並開展相應的研究。在光週期開花途徑研究方面,植物葉片被認為是感知日照長度訊號的主要器官,基因的轉錄水平調控對於葉片維管組織中開花刺激訊號的產生至關重要,而染色質的結構和修飾是決定基因轉錄的關鍵因素。
因此,在植物葉片感知光週期訊號過程中,染色質的開放程度變化是否具有組織細胞特異性,是一個值得研究的科學問題。
近日,首都師範大學
劉良玉
課題組和中國農科院作科所
路則府
研究員合作在
The Plant Cell
線上發表了題為
Photoperiod-responsive changes in chromatin accessibility in phloem companion and epidermis cells of Arabidopsis leaves
的研究論文,揭示了光週期誘導成花轉化過程中,染色質開放程度
(chromatin accessibility)
在葉片維管和表皮細胞中的特異性變化。
研究團隊首先構建了擬南芥維管和表皮細胞特異表達分選標記的遺傳材料,利用INTACT
(Isolation of nuclei tagged in specific cell types)
細胞核分選技術分選富集了高純度的維管和表皮細胞核,並結合ATAC-seq技術檢測不同光週期條件下染色質開放程度變化。在長日照誘導條件下,細胞染色質開放性顯著增強,而維管的染色質鬆散程度變化比表皮中更為顯著,關聯基因在聚類上也體現了細胞功能的特異性。隨後,研究人員結合染色質開放程度和基因表達特徵篩選出功能未知的候選基因,應用遺傳學手段從中鑑定了一個新的開花調控基因
TPS9
,藉助amiRNA技術發現
TPS9
在葉片維管組織中具有調控成花轉化的功能。
因此,該研究揭示了光週期介導的染色質開放程度變化具有顯著的組織細胞特異性及維管組織在植物營養-生殖轉化過程中的重要作用。
光週期誘導過程中維管和表皮細胞核的INTACT分選及染色質開放程度和基因表達分析
首都師範大學為該論文第一完成單位,首都師大研究生
田昊
、
李昱儒
、
王策
、
徐興文
為共同第一作者,
劉良玉
和
路則府
為共同通訊作者。該工作還得到了首都師大
李樂攻
教授、中國農科院作科所
傅永福
研究員和德國馬普植物育種所
Franziska Turck
研究員的大力支援和幫助。該項研究得到國家自然科學基金及北京市高層次人才專案等資助。
論文連結:
https://doi.org/10.1093/plcell/koaa043