進行系統發育分析,用cipres線上搞定
2022-09-06由 科研日精進 發表于 林業
系統發育樹做好了怎麼看
cipres是一個線上的網站,提供以下軟體的線上使用:
RAxML; MrBayes; BEAST; B E A S T 2; GARLI; MAFFT; DPPDIV; FastTree, jModelTest2,Migrate-N。,PAUP*; Poy,C l u s t a l W; Contralign; MUSCLE; P R O B C O N S; PROBALIGN
可以進行系統發育分析。
可以進行系統發育分析
下面僅以mrbayes為例解說,其他軟體都一樣,使用非常簡單:
操作步驟
開啟網頁
https://www.phylo.org/
#FormatImgID_1#
註冊並登陸,進入了這個介面
#FormatImgID_2#新建資料夾
#FormatImgID_3#
輸入資料夾名與描述
#FormatImgID_4#
建立成功,可見資料夾下有資料與任務兩欄。另外還可建立別的資料夾,下層資料夾,編輯與刪除資料夾。
#FormatImgID_5#進入資料資料夾,上傳資料
#FormatImgID_6#
選擇檔案並上傳
#FormatImgID_7#上傳好了,可以複製、移動或刪除
#FormatImgID_8#
點選檔案可以檢視內容
#FormatImgID_9#
點選工作列,新建任務
#FormatImgID_10#
進行描述
#FormatImgID_11#
選擇資料
#FormatImgID_12#選擇工具
#FormatImgID_13#設定引數
#FormatImgID_14#儲存任務並開始跑
#FormatImgID_15#
等待資料跑完,期間可以退出,等跑完再登陸網站檢視
#FormatImgID_16#
跑完了
#FormatImgID_17#檢視結果
#FormatImgID_18#
將結果下載下來
#FormatImgID_19#
下載好了
#FormatImgID_20#
拖進treeview檢視
#FormatImgID_21#
好了,以上就是
使用cipres進行系統發育分析的操作,
希望對你有所幫助。如果對
希望對你有所幫助。如果對
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