蛋白質譜結果怎麼分析

利用質譜儀對蛋白質進行分析鑑定可以得到不同的資料，如一級質譜資料和二級質譜資料，這些質譜資料也就是質譜結果，都需要結合資料庫、軟體等進行生物資訊學分析才能實現蛋白質的鑑定及序列分析等。

蛋白質一級質譜資料主要是分析蛋白質酶切產生的肽段質量圖譜，即肽質量指紋圖譜（Peptide Mass Fingerprint，PMF），再將PMF中的肽質量資料與資料庫中理論肽質量進行比較和評價，從而實現肽段的鑑定。常用的PMF檢索工具主要有PeptIdenet、MS-Fit、ProFound、PeptideSearch等。

在第一階段進行肽質指紋鑑定之後，可以選擇有意義且丰度較高的肽片段進行串聯質譜分析，以獲得更精細的二級質譜資料。串聯質譜技術獲得肽序列圖譜比PMF更復雜，需要藉助計算機軟體輔助識別不同的肽段母離子。可以透過讀出的部分氨基酸序列結合此序列前後的母離子和肽段離子質量，在資料庫進行檢索、比較進而實現蛋白的鑑定；也可以直接用串聯質譜資料進行資料庫檢索，常用的串聯質譜資料檢索工具主要有MS-Taq、MS-Seq、PepFrag、Mascot等。

百泰派克生物科技採用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合nanoLC-MS/MS納升色譜，提供

蛋白質質譜分析

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